Jalview 2.11 | Mac英文版 | 多序列比对软件 | 安装教程下载

软件介

Jalview是一个用于多序列比对编辑、可视化和分析程序。

Jalview是一个用于多序列比对编辑、可视化和分析程序。使用系统发育树和主成分分析 (PCA) 图对序列进行分析,并探索分子结构和注释。

Jalview 内置了 DNA、RNA 、蛋白质序列的结构可视化和分析功能,它使用 Jmol 查看 3D 结构,知识兔使用 VARNA 显示 RNA 二级结构,Jalview 还可以连接数据库进行分析服务。

Jalview使用方法

1. 导入序列

你可以导入你的fasta格式的序列,也有其他很多种形式的格式,自行选择。

2. 多序列比对

序列载入之后,出现的画面。最下面是一些注释信息,你可以选择去掉,或者保留。

选择所有序列后,开始进行序列比对,知识兔选择相应的比对算法,我这里选择muscle方法,并且知识兔是默认参数。

3. 去掉多余的信息并且知识兔分行显示

为了输出多序列比对结果,我们将不必要的信息隐藏,然后知识兔尽量美观的显示序列比对结果。

4. 相似性显示不同颜色,进行美化

一般我们要区分一致性高低的氨基酸,并通过不同颜色来进行更好的可视化。

5. 导出图片

图片格式有很多种,你可以选择不同的格式,一边我们就选PNG,如果知识兔要高质量发表水平的,你可以选择svg或则eps格式。

下载说[软件名称]:Jalview[界面语言]:英文[安装环境]:Intel | M1 | M2都适配[下载链接]:见文末

 

软件安装

1.知识兔双击安装包,直接拖到安装即可。

Jalview 2.11 | Mac英文版 | 多序列比对软件 | 安装教程

2.安装完成,知识兔打开软件。

Jalview 2.11 | Mac英文版 | 多序列比对软件 | 安装教程

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